Nyelvek

Klasszikus és molekuláris bakteriális taxonómia II. GY

Kurzus kód (Neptun): 
baktaxmb17lm
Kurzus tartalma: 
A taxonómia gyakorlatok célja, hogy az előadáson elhangzott ismeretek egy részét a gyakorlati kivitelezés szintjén is megvalósítsuk. A gyakorlaton számozott, többnyire ezidáig részletesen nem vizsgált baktériumtörzsekkel fogunk dolgozni. Főleg diagnosztikai értékű vizsgálatokat végzünk, fenotípus és genotípus szintjén. Leoltjuk a törzseket Hugh és Leifson médiumba, glükózból vizsgáljuk a fermentatív és oxidatív savképzést. Elvégezzük a törzsek Gram szerinti festését, a baktériumok méretét is meghatározzuk. Néhány ökológiai vizsgálattal és enzimaktivitási vizsgálattal teszteljük őket. Meghatározzuk minden törzs membránzsírsavainak összetételét is. Az API rendszer segítségével több fenotípusos bélyeg egyidejű tanulmányozását végezzük el . Megismerjük a baktériumok molekuláris biológiai módszerekkel történő identifikációjának és rendszerezésének alapjait. Mivel a különböző polimeráz láncreakciók és a terminációs szekvenálás más, korábbi gyakorlatok anyaga, itt már csak a kész szekvencia ellenőrzésével, illesztésével, filogenetikai fák szerkesztésével foglalkozunk. Munkánk során több szoftvert és online adatbázist is használunk, amelyek más szervezetek molekuláris identifikálásához, illetve egyéb molekuláris biológiai munkák során is alkalmazhatóak.